Protein–RNA interactions for Protein: O95155

UBE4B, Ubiquitin conjugation factor E4 B, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4BO95155 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms