Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHOBTB3O94955 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOBTB3O94955 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms