Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL18O94889 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms