Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG12O94817 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG12O94817 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG12O94817 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG12O94817 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG12O94817 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG12O94817 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG12O94817 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG12O94817 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG12O94817 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG12O94817 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG12O94817 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG12O94817 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG12O94817 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG12O94817 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG12O94817 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG12O94817 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG12O94817 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG12O94817 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG12O94817 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG12O94817 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG12O94817 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG12O94817 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG12O94817 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG12O94817 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG12O94817 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG12O94817 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG12O94817 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG12O94817 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG12O94817 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG12O94817 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG12O94817 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG12O94817 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG12O94817 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG12O94817 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG12O94817 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG12O94817 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG12O94817 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG12O94817 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG12O94817 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG12O94817 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG12O94817 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG12O94817 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG12O94817 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG12O94817 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG12O94817 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG12O94817 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG12O94817 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG12O94817 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG12O94817 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG12O94817 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG12O94817 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG12O94817 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG12O94817 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG12O94817 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG12O94817 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG12O94817 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG12O94817 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG12O94817 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG12O94817 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG12O94817 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG12O94817 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG12O94817 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG12O94817 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG12O94817 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG12O94817 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG12O94817 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG12O94817 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG12O94817 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG12O94817 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG12O94817 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG12O94817 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG12O94817 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG12O94817 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG12O94817 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG12O94817 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG12O94817 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG12O94817 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG12O94817 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG12O94817 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG12O94817 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG12O94817 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG12O94817 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG12O94817 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG12O94817 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG12O94817 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG12O94817 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG12O94817 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG12O94817 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG12O94817 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG12O94817 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG12O94817 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG12O94817 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG12O94817 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG12O94817 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG12O94817 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG12O94817 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATG12O94817 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATG12O94817 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATG12O94817 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.9 ms