Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA10O75578 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA10O75578 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA10O75578 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA10O75578 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA10O75578 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA10O75578 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA10O75578 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA10O75578 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA10O75578 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA10O75578 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA10O75578 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA10O75578 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA10O75578 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA10O75578 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA10O75578 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA10O75578 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA10O75578 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA10O75578 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA10O75578 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA10O75578 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA10O75578 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA10O75578 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA10O75578 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA10O75578 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA10O75578 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA10O75578 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA10O75578 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA10O75578 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA10O75578 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA10O75578 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA10O75578 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms