Protein–RNA interactions for Protein: O75439

PMPCB, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCBO75439 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMPCBO75439 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMPCBO75439 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms