Protein–RNA interactions for Protein: O75427

LRCH4, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH4O75427 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
LRCH4O75427 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRCH4O75427 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRCH4O75427 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms