Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX3O75364 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX3O75364 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX3O75364 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX3O75364 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX3O75364 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX3O75364 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX3O75364 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX3O75364 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX3O75364 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX3O75364 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX3O75364 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX3O75364 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX3O75364 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX3O75364 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX3O75364 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX3O75364 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX3O75364 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX3O75364 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX3O75364 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX3O75364 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX3O75364 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX3O75364 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX3O75364 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX3O75364 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX3O75364 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX3O75364 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX3O75364 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX3O75364 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX3O75364 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX3O75364 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX3O75364 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX3O75364 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX3O75364 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX3O75364 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX3O75364 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX3O75364 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX3O75364 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX3O75364 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX3O75364 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX3O75364 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX3O75364 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX3O75364 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX3O75364 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX3O75364 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX3O75364 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX3O75364 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX3O75364 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX3O75364 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX3O75364 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX3O75364 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX3O75364 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX3O75364 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PITX3O75364 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PITX3O75364 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PITX3O75364 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PITX3O75364 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PITX3O75364 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PITX3O75364 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PITX3O75364 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PITX3O75364 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX3O75364 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX3O75364 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX3O75364 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX3O75364 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX3O75364 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX3O75364 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX3O75364 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX3O75364 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX3O75364 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX3O75364 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX3O75364 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX3O75364 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX3O75364 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX3O75364 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX3O75364 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX3O75364 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX3O75364 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX3O75364 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX3O75364 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX3O75364 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX3O75364 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX3O75364 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX3O75364 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX3O75364 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX3O75364 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX3O75364 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX3O75364 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX3O75364 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX3O75364 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX3O75364 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX3O75364 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX3O75364 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX3O75364 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX3O75364 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX3O75364 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX3O75364 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX3O75364 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX3O75364 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX3O75364 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms