Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DHX16O60231 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DHX16O60231 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DHX16O60231 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DHX16O60231 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DHX16O60231 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DHX16O60231 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DHX16O60231 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DHX16O60231 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DHX16O60231 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DHX16O60231 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DHX16O60231 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DHX16O60231 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DHX16O60231 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DHX16O60231 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DHX16O60231 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DHX16O60231 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DHX16O60231 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DHX16O60231 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DHX16O60231 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DHX16O60231 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DHX16O60231 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DHX16O60231 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DHX16O60231 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DHX16O60231 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DHX16O60231 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DHX16O60231 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DHX16O60231 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DHX16O60231 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DHX16O60231 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DHX16O60231 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DHX16O60231 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DHX16O60231 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DHX16O60231 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DHX16O60231 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DHX16O60231 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
DHX16O60231 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DHX16O60231 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DHX16O60231 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
DHX16O60231 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DHX16O60231 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DHX16O60231 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DHX16O60231 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DHX16O60231 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
DHX16O60231 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DHX16O60231 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DHX16O60231 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DHX16O60231 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DHX16O60231 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DHX16O60231 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DHX16O60231 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
DHX16O60231 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DHX16O60231 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DHX16O60231 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DHX16O60231 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DHX16O60231 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DHX16O60231 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DHX16O60231 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DHX16O60231 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DHX16O60231 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DHX16O60231 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DHX16O60231 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DHX16O60231 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DHX16O60231 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DHX16O60231 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DHX16O60231 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DHX16O60231 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DHX16O60231 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DHX16O60231 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DHX16O60231 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DHX16O60231 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
DHX16O60231 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DHX16O60231 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DHX16O60231 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DHX16O60231 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DHX16O60231 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DHX16O60231 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DHX16O60231 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DHX16O60231 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DHX16O60231 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
DHX16O60231 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
DHX16O60231 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DHX16O60231 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DHX16O60231 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DHX16O60231 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DHX16O60231 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DHX16O60231 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DHX16O60231 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DHX16O60231 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
DHX16O60231 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DHX16O60231 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DHX16O60231 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DHX16O60231 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DHX16O60231 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DHX16O60231 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DHX16O60231 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DHX16O60231 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DHX16O60231 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DHX16O60231 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DHX16O60231 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms