Protein–RNA interactions for Protein: O43920

NDUFS5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS5O43920 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
NDUFS5O43920 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NDUFS5O43920 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms