Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBDO15205 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBDO15205 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBDO15205 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBDO15205 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBDO15205 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBDO15205 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBDO15205 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
UBDO15205 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBDO15205 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBDO15205 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBDO15205 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
UBDO15205 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBDO15205 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBDO15205 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBDO15205 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBDO15205 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBDO15205 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBDO15205 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBDO15205 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBDO15205 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBDO15205 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBDO15205 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBDO15205 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBDO15205 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBDO15205 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBDO15205 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBDO15205 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBDO15205 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBDO15205 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBDO15205 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBDO15205 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBDO15205 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBDO15205 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
UBDO15205 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBDO15205 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBDO15205 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBDO15205 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBDO15205 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBDO15205 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBDO15205 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
UBDO15205 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
UBDO15205 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
UBDO15205 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBDO15205 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBDO15205 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBDO15205 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBDO15205 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBDO15205 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBDO15205 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
UBDO15205 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBDO15205 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBDO15205 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBDO15205 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBDO15205 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBDO15205 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBDO15205 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBDO15205 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
UBDO15205 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBDO15205 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBDO15205 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBDO15205 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBDO15205 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBDO15205 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBDO15205 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBDO15205 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBDO15205 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBDO15205 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBDO15205 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
UBDO15205 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBDO15205 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBDO15205 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBDO15205 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBDO15205 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBDO15205 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBDO15205 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBDO15205 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBDO15205 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
UBDO15205 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBDO15205 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBDO15205 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBDO15205 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBDO15205 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBDO15205 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBDO15205 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBDO15205 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBDO15205 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBDO15205 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBDO15205 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBDO15205 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBDO15205 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
UBDO15205 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBDO15205 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBDO15205 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBDO15205 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBDO15205 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBDO15205 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBDO15205 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBDO15205 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBDO15205 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms