Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAMP3O14828 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms