Protein–RNA interactions for Protein: O14745

SLC9A3R1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3R1O14745 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A3R1O14745 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A3R1O14745 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A3R1O14745 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A3R1O14745 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A3R1O14745 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A3R1O14745 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A3R1O14745 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A3R1O14745 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A3R1O14745 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A3R1O14745 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A3R1O14745 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A3R1O14745 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC9A3R1O14745 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC9A3R1O14745 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A3R1O14745 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC9A3R1O14745 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC9A3R1O14745 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC9A3R1O14745 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms