Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PODXLO00592 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PODXLO00592 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PODXLO00592 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PODXLO00592 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PODXLO00592 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PODXLO00592 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PODXLO00592 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PODXLO00592 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PODXLO00592 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PODXLO00592 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PODXLO00592 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PODXLO00592 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PODXLO00592 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PODXLO00592 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PODXLO00592 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PODXLO00592 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PODXLO00592 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PODXLO00592 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PODXLO00592 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PODXLO00592 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PODXLO00592 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PODXLO00592 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PODXLO00592 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PODXLO00592 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PODXLO00592 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PODXLO00592 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PODXLO00592 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PODXLO00592 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PODXLO00592 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PODXLO00592 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PODXLO00592 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PODXLO00592 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PODXLO00592 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PODXLO00592 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PODXLO00592 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PODXLO00592 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PODXLO00592 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PODXLO00592 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PODXLO00592 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PODXLO00592 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PODXLO00592 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PODXLO00592 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PODXLO00592 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PODXLO00592 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PODXLO00592 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PODXLO00592 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PODXLO00592 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PODXLO00592 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PODXLO00592 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PODXLO00592 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PODXLO00592 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PODXLO00592 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PODXLO00592 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PODXLO00592 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PODXLO00592 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PODXLO00592 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PODXLO00592 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PODXLO00592 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PODXLO00592 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PODXLO00592 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PODXLO00592 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PODXLO00592 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PODXLO00592 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PODXLO00592 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PODXLO00592 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PODXLO00592 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PODXLO00592 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PODXLO00592 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PODXLO00592 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PODXLO00592 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PODXLO00592 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PODXLO00592 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PODXLO00592 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PODXLO00592 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PODXLO00592 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PODXLO00592 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PODXLO00592 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PODXLO00592 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PODXLO00592 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PODXLO00592 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PODXLO00592 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PODXLO00592 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PODXLO00592 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PODXLO00592 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PODXLO00592 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PODXLO00592 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PODXLO00592 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PODXLO00592 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PODXLO00592 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PODXLO00592 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PODXLO00592 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PODXLO00592 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PODXLO00592 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PODXLO00592 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PODXLO00592 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PODXLO00592 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PODXLO00592 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PODXLO00592 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PODXLO00592 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms