Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DFFAO00273 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DFFAO00273 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DFFAO00273 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DFFAO00273 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DFFAO00273 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DFFAO00273 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DFFAO00273 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DFFAO00273 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DFFAO00273 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DFFAO00273 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DFFAO00273 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DFFAO00273 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DFFAO00273 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DFFAO00273 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DFFAO00273 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DFFAO00273 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DFFAO00273 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DFFAO00273 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DFFAO00273 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DFFAO00273 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DFFAO00273 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DFFAO00273 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DFFAO00273 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DFFAO00273 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DFFAO00273 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DFFAO00273 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DFFAO00273 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DFFAO00273 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DFFAO00273 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DFFAO00273 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DFFAO00273 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DFFAO00273 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DFFAO00273 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DFFAO00273 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DFFAO00273 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DFFAO00273 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DFFAO00273 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DFFAO00273 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DFFAO00273 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DFFAO00273 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DFFAO00273 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DFFAO00273 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DFFAO00273 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DFFAO00273 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DFFAO00273 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DFFAO00273 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DFFAO00273 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DFFAO00273 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DFFAO00273 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DFFAO00273 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DFFAO00273 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DFFAO00273 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DFFAO00273 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DFFAO00273 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DFFAO00273 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DFFAO00273 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DFFAO00273 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DFFAO00273 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DFFAO00273 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DFFAO00273 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DFFAO00273 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DFFAO00273 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DFFAO00273 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DFFAO00273 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DFFAO00273 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DFFAO00273 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DFFAO00273 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DFFAO00273 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DFFAO00273 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DFFAO00273 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DFFAO00273 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DFFAO00273 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DFFAO00273 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DFFAO00273 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DFFAO00273 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DFFAO00273 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DFFAO00273 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DFFAO00273 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DFFAO00273 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DFFAO00273 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DFFAO00273 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
DFFAO00273 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
DFFAO00273 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DFFAO00273 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DFFAO00273 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DFFAO00273 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DFFAO00273 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DFFAO00273 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DFFAO00273 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DFFAO00273 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DFFAO00273 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DFFAO00273 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DFFAO00273 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DFFAO00273 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DFFAO00273 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DFFAO00273 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DFFAO00273 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DFFAO00273 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DFFAO00273 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms