Protein–RNA interactions for Protein: E7EW58

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3E7EW58 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRN3E7EW58 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRN3E7EW58 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRN3E7EW58 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRN3E7EW58 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRN3E7EW58 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRN3E7EW58 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRN3E7EW58 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRN3E7EW58 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN3E7EW58 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN3E7EW58 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN3E7EW58 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN3E7EW58 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN3E7EW58 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN3E7EW58 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN3E7EW58 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN3E7EW58 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN3E7EW58 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN3E7EW58 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN3E7EW58 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN3E7EW58 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN3E7EW58 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN3E7EW58 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN3E7EW58 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN3E7EW58 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRN3E7EW58 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRN3E7EW58 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRN3E7EW58 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRN3E7EW58 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRN3E7EW58 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRN3E7EW58 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRN3E7EW58 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRN3E7EW58 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRN3E7EW58 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms