Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLDN25C9JDP6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN25C9JDP6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms