Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C5orf58C9J3I9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C5orf58C9J3I9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C5orf58C9J3I9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C5orf58C9J3I9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C5orf58C9J3I9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C5orf58C9J3I9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C5orf58C9J3I9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C5orf58C9J3I9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C5orf58C9J3I9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C5orf58C9J3I9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C5orf58C9J3I9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C5orf58C9J3I9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C5orf58C9J3I9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C5orf58C9J3I9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C5orf58C9J3I9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C5orf58C9J3I9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
C5orf58C9J3I9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C5orf58C9J3I9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C5orf58C9J3I9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C5orf58C9J3I9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C5orf58C9J3I9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C5orf58C9J3I9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C5orf58C9J3I9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C5orf58C9J3I9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C5orf58C9J3I9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C5orf58C9J3I9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C5orf58C9J3I9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C5orf58C9J3I9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C5orf58C9J3I9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
C5orf58C9J3I9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C5orf58C9J3I9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C5orf58C9J3I9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C5orf58C9J3I9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C5orf58C9J3I9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C5orf58C9J3I9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C5orf58C9J3I9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
C5orf58C9J3I9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
C5orf58C9J3I9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C5orf58C9J3I9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C5orf58C9J3I9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms