Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HACD1B0YJ81 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms