Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOBPA7XYQ1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
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