Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
KNCNA6PVL3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms