Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCDC69A6NI79 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC69A6NI79 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms