Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms