Protein–RNA interactions for Protein: A0A578

TCRBV5S1A1T, T-cell receptor beta variable 5-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S1A1TA0A578 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCRBV5S1A1TA0A578 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCRBV5S1A1TA0A578 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCRBV5S1A1TA0A578 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCRBV5S1A1TA0A578 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCRBV5S1A1TA0A578 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCRBV5S1A1TA0A578 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCRBV5S1A1TA0A578 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCRBV5S1A1TA0A578 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCRBV5S1A1TA0A578 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCRBV5S1A1TA0A578 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCRBV5S1A1TA0A578 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCRBV5S1A1TA0A578 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TCRBV5S1A1TA0A578 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCRBV5S1A1TA0A578 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCRBV5S1A1TA0A578 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCRBV5S1A1TA0A578 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCRBV5S1A1TA0A578 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TCRBV5S1A1TA0A578 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCRBV5S1A1TA0A578 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
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TCRBV5S1A1TA0A578 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
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TCRBV5S1A1TA0A578 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
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TCRBV5S1A1TA0A578 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
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TCRBV5S1A1TA0A578 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
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TCRBV5S1A1TA0A578 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
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TCRBV5S1A1TA0A578 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
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TCRBV5S1A1TA0A578 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCRBV5S1A1TA0A578 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
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