Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVM2

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GVM2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1B0GVM2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1B0GVM2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1B0GVM2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1B0GVM2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1B0GVM2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1B0GVM2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1B0GVM2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1B0GVM2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1B0GVM2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1B0GVM2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1B0GVM2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1B0GVM2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1B0GVM2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1B0GVM2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1B0GVM2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1B0GVM2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1B0GVM2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1B0GVM2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1B0GVM2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1B0GVM2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1B0GVM2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1B0GVM2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1B0GVM2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1B0GVM2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1B0GVM2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1B0GVM2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1B0GVM2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms