Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTW7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GTW7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A1B0GTW7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A1B0GTW7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms