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| PTPRJ | Q12913 | LILRA5-201 | ENST00000432233 | 1363 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 13.97 | □□□□□ -0.17 | | |
| PTPRJ | Q12913 | C11orf87-201 | ENST00000327419 | 5884 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.97 | □□□□□ -0.17 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MATR3-233 | ENST00000504203 | 2243 nt | TSL 2 BASIC | 13.97 | □□□□□ -0.17 | | |
| PTPRJ | Q12913 | FAM78A-203 | ENST00000372271 | 3966 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.97 | □□□□□ -0.17 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TESK2-202 | ENST00000372086 | 3074 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.97 | □□□□□ -0.17 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ACTN1-204 | ENST00000438964 | 3043 nt | TSL 1 (best) BASIC | 13.97 | □□□□□ -0.17 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | MRPL18-201 | ENST00000367034 | 978 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.97 | □□□□□ -0.17 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | KDM6B-201 | ENST00000254846 | 6713 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 13.97 | □□□□□ -0.17 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CES1-201 | ENST00000360526 | 2006 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 13.97 | □□□□□ -0.17 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ALLC-201 | ENST00000252505 | 1446 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.97 | □□□□□ -0.17 | | |
| PTPRJ | Q12913 | DFFB-201 | ENST00000338895 | 3105 nt | TSL 2 BASIC | 13.96 | □□□□□ -0.17 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | PTPN5-203 | ENST00000396168 | 2796 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.96 | □□□□□ -0.17 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MESD-201 | ENST00000261758 | 4264 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.96 | □□□□□ -0.17 | | |
| PTPRJ | Q12913 | GRM1-201 | ENST00000282753 | 6622 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 13.96 | □□□□□ -0.17 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | PASK-201 | ENST00000234040 | 4572 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 13.96 | □□□□□ -0.17 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | BX088651.4-202 | ENST00000428895 | 1479 nt | TSL 1 (best) BASIC | 13.96 | □□□□□ -0.18 | | |
| PTPRJ | Q12913 | GMIP-201 | ENST00000203556 | 3538 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.96 | □□□□□ -0.18 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | TMEM25-208 | ENST00000524725 | 2630 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 13.96 | □□□□□ -0.18 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SLC48A1-201 | ENST00000442218 | 3010 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.96 | □□□□□ -0.18 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PURA-201 | ENST00000331327 | 11497 nt | APPRIS P1 BASIC | 13.96 | □□□□□ -0.18 | | |
| PTPRJ | Q12913 | FAM238C-202 | ENST00000639963 | 1787 nt | TSL 2 BASIC | 13.96 | □□□□□ -0.18 | | |
| PTPRJ | Q12913 | DLX1-201 | ENST00000341900 | 2130 nt | TSL 1 (best) BASIC | 13.95 | □□□□□ -0.18 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LILRB1-203 | ENST00000396317 | 2103 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 13.95 | □□□□□ -0.18 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PLA2G4E-AS1-201 | ENST00000499478 | 2499 nt | TSL 1 (best) BASIC | 13.95 | □□□□□ -0.18 | | |
| PTPRJ | Q12913 | NTF3-202 | ENST00000423158 | 1336 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 13.95 | □□□□□ -0.18 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TNFRSF21-201 | ENST00000296861 | 3595 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.95 | □□□□□ -0.18 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LGALSL-201 | ENST00000238875 | 3926 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.95 | □□□□□ -0.18 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RIPK4-201 | ENST00000332512 | 3889 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.95 | □□□□□ -0.18 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TRIM31-210 | ENST00000376734 | 2043 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 13.95 | □□□□□ -0.18 | | |