Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 DLX5-201ENST00000222598 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 TBC1D3P1-201ENST00000590047 1693 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ELOA2-201ENST00000332567 3050 ntAPPRIS P2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 PAX6-201ENST00000241001 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 TMEM174-201ENST00000296776 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 C9orf64-201ENST00000314700 2067 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CACNA1C-205ENST00000399591 6535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CACNA1C-206ENST00000399595 6535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CACNA1C-207ENST00000399597 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CACNA1C-208ENST00000399601 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CACNA1C-217ENST00000399641 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CACNA1C-218ENST00000399644 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 TRIOBP-204ENST00000406386 10129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP6-205ENST00000380736 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 UBIAD1-202ENST00000376810 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ZFYVE27-207ENST00000423811 3045 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 PPP2R1A-205ENST00000462990 2730 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 MBP-207ENST00000397865 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 SFTPA1-203ENST00000428376 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CD36-207ENST00000432207 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 WIPF1-204ENST00000392547 4587 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 RIPOR1-205ENST00000540839 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ADGRE5-203ENST00000358600 2751 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 WNK4-201ENST00000246914 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ERBB2-218ENST00000584450 3730 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 DIRAS1-201ENST00000323469 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 KRT18P40-201ENST00000599859 1571 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 UEVLD-213ENST00000543987 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AL592528.1-201ENST00000380008 3466 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 HNRNPA1P33-201ENST00000421426 561 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 SLC25A36-208ENST00000507429 3537 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 PAX9-201ENST00000361487 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 PLEC-201ENST00000322810 15249 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 IGF2BP2-201ENST00000346192 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ATAT1-205ENST00000376483 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AIPL1-203ENST00000381129 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 KLF6-206ENST00000497571 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 SNAI1-201ENST00000244050 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ANXA4-201ENST00000394295 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 LIMK1-201ENST00000336180 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AC133919.3-201ENST00000621407 1804 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ZNF461-204ENST00000588268 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 PPARD-203ENST00000360694 3747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 NDEL1-203ENST00000402554 1858 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 VAC14-AS1-202ENST00000562507 4853 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AC010997.4-201ENST00000609200 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AC005865.1-201ENST00000432994 3004 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 LINC02052-202ENST00000427914 2285 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 VPS33A-201ENST00000267199 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 EXD2-206ENST00000409949 2688 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 APLF-201ENST00000303795 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CENPP-201ENST00000375576 3088 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ZEB2-234ENST00000636413 8984 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 SEMA3F-206ENST00000434342 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 SPATA13-202ENST00000382095 6665 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 GEMIN4-207ENST00000576778 4729 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 SCO1-201ENST00000255390 9612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 MYH4-201ENST00000255381 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms