Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 PPP2R1B-202ENST00000341980 1953 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 OAS1-203ENST00000452357 1990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AC010210.1-201ENST00000502521 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AL662907.1-201ENST00000622988 1360 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 TMEM94-209ENST00000579208 3543 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AL022238.4-201ENST00000639722 4563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 LINC01227-205ENST00000567317 1338 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 TM9SF2-201ENST00000376387 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 GNG4-204ENST00000450593 4978 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 ZNF596-203ENST00000398612 2863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 MPPE1-204ENST00000344987 1831 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 MRPL27-201ENST00000225969 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 SLC18A1-202ENST00000276373 2753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 FOSB-202ENST00000417353 3667 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 BRD4-203ENST00000371835 4624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 C20orf96-203ENST00000400269 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 STRADA-253ENST00000640979 2086 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 TTC23-204ENST00000394135 2496 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 HOXA-AS2-201ENST00000517550 2022 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 TGS1-201ENST00000260129 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 LRRC46-201ENST00000269025 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 MAMDC2-201ENST00000377182 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 TIMM22-201ENST00000327158 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 TEF-202ENST00000406644 4386 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 ACAD11-204ENST00000481970 1891 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 KIF18BP1-201ENST00000567585 2264 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 DPY19L2P2-204ENST00000438364 3947 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 LRRC32-203ENST00000407242 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 ARSJ-201ENST00000315366 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 PNPLA7-201ENST00000277531 4581 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 THRB-206ENST00000416420 2571 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 UQCC1-201ENST00000349714 2188 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 PRIMPOL-209ENST00000512834 2174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 PRICKLE1-209ENST00000552240 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 TAF5L-203ENST00000366675 4062 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 SUN2-202ENST00000405510 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 C6orf163-203ENST00000608326 2110 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 ALDH3B2-204ENST00000530069 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 SEC61A1-202ENST00000424880 3238 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 SEPT6-205ENST00000394610 4694 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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