Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 AC055717.2-201ENST00000561864 577 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 LINC00643-207ENST00000637212 734 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 TRIM46-201ENST00000334634 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 TSPEAR-204ENST00000614657 4027 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 RCAN2-202ENST00000330430 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 FAM102A-203ENST00000373095 4144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 GRAMD1B-202ENST00000450171 2431 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 ASAH1-202ENST00000314146 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 ZNF169-204ENST00000481550 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 PTPN11-205ENST00000635625 1794 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 NF2-207ENST00000397789 1857 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 MAGEB10-201ENST00000356790 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 CNTROB-202ENST00000563694 3705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 SPAG5-201ENST00000321765 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 VPS33B-201ENST00000333371 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 KDM6A-214ENST00000621147 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 DHODH-205ENST00000572887 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 TESK2-202ENST00000372086 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 PRKCQ-201ENST00000263125 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 RAVER1-201ENST00000293677 3595 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 AL022238.4-201ENST00000639722 4563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 PDIA6-204ENST00000404824 2236 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 UEVLD-213ENST00000543987 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 MYL9-201ENST00000279022 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 FBXO22-201ENST00000308275 10725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 PLEKHA5-203ENST00000429027 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 RINT1-201ENST00000257700 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 NTM-221ENST00000539799 2550 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 SPRYD3-204ENST00000547837 1655 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 GZF1-201ENST00000338121 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 ASMT-203ENST00000381241 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 LARGE1-202ENST00000397394 4138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 AP001120.3-201ENST00000585729 489 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 ARHGAP25-203ENST00000409220 2939 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 PCDHGA6-201ENST00000517434 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 VAV1-202ENST00000539284 2627 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 KLLN-201ENST00000445946 4277 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 IKZF4-203ENST00000547167 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 C6orf163-203ENST00000608326 2110 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 CHID1-205ENST00000454838 3255 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 FCHO1-234ENST00000600676 3094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 AL359317.2-201ENST00000554898 1826 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 TRIML2-207ENST00000512729 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 AC018521.1-202ENST00000641877 2655 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 ENPP4-201ENST00000321037 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 NDRG4-203ENST00000394279 3431 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 ZNF552-201ENST00000391701 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 BCKDK-204ENST00000394951 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 AC019294.1-202ENST00000566174 2071 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 RPL13AP17-204ENST00000450028 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 TAS1R2-201ENST00000375371 2542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 DNMT1-202ENST00000359526 5206 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 PLEKHG5-203ENST00000377728 3613 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 CFAP43-204ENST00000369720 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 DBH-202ENST00000393056 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 INTS9-201ENST00000416984 2759 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 NPLOC4-202ENST00000374747 5538 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 DCAKD-203ENST00000452796 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 C9orf3-203ENST00000375315 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 CAMTA2-202ENST00000361571 4777 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 IGSF9-202ENST00000368094 4044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKOR2Q2VWA4 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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