Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 KCNH8-201ENST00000328405 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 AC006033.2-201ENST00000609522 1968 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 AC096564.1-201ENST00000499098 2810 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 PRKG2-201ENST00000264399 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 ACAD11-204ENST00000481970 1891 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 GUCY1B3-202ENST00000502959 2255 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 PYGL-206ENST00000544180 2696 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 FOXJ3-202ENST00000361776 5106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 AL031666.1-201ENST00000413818 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 CUL9-201ENST00000252050 7780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 FOSB-203ENST00000443841 3346 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 ZNF143-203ENST00000396602 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 UBOX5-202ENST00000348031 4469 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 TP73-206ENST00000378288 5120 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 MOB3C-201ENST00000271139 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 KDM6A-201ENST00000377967 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 HMGCS1-201ENST00000325110 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 CNTROB-203ENST00000565740 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 TAOK2-201ENST00000279394 4246 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 AC024028.1-201ENST00000437145 437 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 ALDOA-229ENST00000636698 420 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 KCNH1-202ENST00000367007 3445 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 CDC45-201ENST00000263201 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 LGR5-202ENST00000536515 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 ZSCAN5C-202ENST00000534327 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 HDGF-203ENST00000368209 2171 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 SEC23B-201ENST00000262544 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 EFHD1-203ENST00000409708 1817 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 PABPC1P2-201ENST00000471997 1805 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 GGTA1P-202ENST00000481534 3429 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 RGS16-201ENST00000367558 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 ZKSCAN5-202ENST00000394170 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 DPF2-202ENST00000415073 2085 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 AC000068.1-201ENST00000431090 2097 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 TFDP2-215ENST00000489671 9857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 ZMYND11-203ENST00000381591 4229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 ZCWPW1-208ENST00000490721 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 TRO-202ENST00000319167 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 TRO-203ENST00000375022 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 MIR22HG-208ENST00000574306 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 ENTPD3-203ENST00000445129 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 ADAM19-201ENST00000257527 6481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 PHB-215ENST00000617874 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 UBR7-201ENST00000013070 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 ZMIZ2-215ENST00000615423 2772 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms