Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 DGKH-202ENST00000337343 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 SLC22A6-202ENST00000377871 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 LILRB1-202ENST00000396315 2157 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 PTPRG-201ENST00000295874 4650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 CICP18-201ENST00000406017 2812 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 DDX11L2-201ENST00000437401 1398 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 TEF-202ENST00000406644 4386 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 COL22A1-203ENST00000435777 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 PCDHGB2-201ENST00000522605 4602 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 TNKS-213ENST00000522110 2900 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AC009533.1-201ENST00000539757 3158 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 ALOX5-201ENST00000374391 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 PECR-201ENST00000265322 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 TGOLN2-206ENST00000444342 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 CPNE4-201ENST00000429747 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 TIAF1-201ENST00000359450 5337 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 ZC2HC1C-203ENST00000524913 4283 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 DPAGT1-201ENST00000354202 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 CDH4-203ENST00000614565 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 UMPS-201ENST00000232607 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 INPP5D-204ENST00000445964 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 DBIL5P-203ENST00000536214 2677 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 CNTNAP2-207ENST00000628930 1944 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 PCDHB6-201ENST00000231136 3266 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 ARL13B-201ENST00000303097 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 ZNF461-201ENST00000360357 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 CYP4F11-201ENST00000248041 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 NBPF17P-201ENST00000401087 2119 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 RN7SKP102-201ENST00000411186 315 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AL365203.1-201ENST00000450890 1048 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AC136604.2-201ENST00000500262 1966 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 RNF213-201ENST00000319921 5316 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 FAM160B2-201ENST00000289921 4245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AOC2-201ENST00000253799 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 IGSF9-201ENST00000361509 3996 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 QRICH1-204ENST00000424300 3009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 LGALS3BP-201ENST00000262776 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 ZWILCH-209ENST00000565627 1845 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 SOCS2-AS1-201ENST00000499137 3325 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 TAOK2-201ENST00000279394 4246 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 MAN2B1-201ENST00000221363 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AL357054.4-201ENST00000606285 2814 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 DPH2-201ENST00000255108 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 MKX-202ENST00000419761 3638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 ITGAL-203ENST00000433423 1416 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 LINC02202-201ENST00000499583 2664 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 DAND5-201ENST00000317060 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 ETFBKMT-205ENST00000538463 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 FREM3-201ENST00000329798 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 ACOT11-201ENST00000343744 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 OR2B11-202ENST00000641149 6414 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 RGPD8-203ENST00000409750 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 COPS7A-201ENST00000229251 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 MEG3-214ENST00000519709 1726 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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