Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 SP140L-205ENST00000458341 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 TUBD1-202ENST00000340993 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AC015813.5-201ENST00000624641 1514 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 ULBP3-201ENST00000367339 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 ASPDH-201ENST00000376916 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 RPE-208ENST00000436630 1128 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 RPL21P135-201ENST00000442539 791 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AC104115.1-201ENST00000484005 623 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 RN7SL2-201ENST00000490232 300 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 WASIR2-201ENST00000527434 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AC100858.2-201ENST00000531948 487 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AC063924.1-201ENST00000546680 673 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AC142381.4-201ENST00000566806 702 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AC142086.5-201ENST00000567619 702 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 RN7SL4P-201ENST00000584058 295 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 GTF3A-209ENST00000640289 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AL031590.1-202ENST00000641466 1737 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AC011239.2-201ENST00000624820 1489 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 FAM238C-202ENST00000639963 1787 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 RNA5SP84-201ENST00000364740 107 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms