Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AC023824.6-201ENST00000565523 703 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 Metazoa_SRP.51-201ENST00000570437 272 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 CU638689.3-201ENST00000624266 1031 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 ALDH1A2-204ENST00000537372 3700 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 VLDLR-203ENST00000382100 9163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 SRL-202ENST00000537996 1814 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 LINC00222-207ENST00000448744 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 JAML-211ENST00000533261 1508 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 SYCE1-201ENST00000303903 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 BNIP1-203ENST00000352523 1143 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 SH3BGR-204ENST00000380637 1014 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 INSL6-201ENST00000381641 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 OR10D5P-201ENST00000392760 915 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AL662860.1-201ENST00000436804 877 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 ZNF816-205ENST00000438970 491 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AL353803.1-201ENST00000439014 800 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AC104623.1-201ENST00000446357 546 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 RPS19P7-201ENST00000455650 396 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 SNRPCP5-201ENST00000531775 189 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 SNHG14-220ENST00000553149 513 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 ALOX12-AS1-203ENST00000570562 567 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AC127496.3-201ENST00000576032 494 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 GPSM3-210ENST00000619085 1177 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 RAB5B-211ENST00000628569 496 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 CAMK4-201ENST00000282356 12240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
ATRXP46100 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
ATRXP46100 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
ATRXP46100 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
ATRXP46100 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
ATRXP46100 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
ATRXP46100 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
ATRXP46100 IL36A-201ENST00000259211 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 SETD4-202ENST00000399201 1212 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 SETD4-203ENST00000399205 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC007312.1-201ENST00000427493 258 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 FXYD6P2-201ENST00000444174 288 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 LAMTOR5-AS1-202ENST00000457535 817 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 KRT19P3-201ENST00000507547 828 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 STAMBP-211ENST00000536064 845 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AP003028.1-201ENST00000577699 1033 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 TUBB8P5-201ENST00000445286 1351 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AL109615.2-201ENST00000455005 1608 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 GTF2F2-201ENST00000340473 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 DEFA1-202ENST00000382692 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 ZNF589-202ENST00000412564 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 GSTK1-205ENST00000443571 850 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 VPS33A-202ENST00000451053 1154 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 SLC25A51P3-201ENST00000521814 889 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC013356.4-201ENST00000558421 482 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC002519.2-201ENST00000563575 539 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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