Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 RORC-201ENST00000318247 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 C17orf51-201ENST00000391411 7914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 PTCH1-209ENST00000437951 8049 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 EME1-207ENST00000511648 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 DRD3-204ENST00000467632 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 ABL2-202ENST00000367623 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 CNTROB-202ENST00000563694 3705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 SLC26A4-201ENST00000265715 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 ATAT1-205ENST00000376483 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 TMEM107-205ENST00000449985 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 ALDOA-229ENST00000636698 420 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 GRIP2-205ENST00000621039 7752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 UBXN4-201ENST00000272638 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 FXR1-220ENST00000491062 1768 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 SLC8A3-207ENST00000528359 2840 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 SLC8A3-210ENST00000534137 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 UBASH3A-201ENST00000291535 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 JAK3-204ENST00000527670 3996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 TLE3-208ENST00000557907 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 IP6K1-201ENST00000321599 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC068775.1-201ENST00000322446 2142 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AL645608.3-201ENST00000448179 3043 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC012676.5-201ENST00000624337 1955 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 SEC14L1-204ENST00000436233 5295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 FAN1-201ENST00000362065 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 PKM-202ENST00000335181 2318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 GREB1-204ENST00000381486 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 GNG11-201ENST00000248564 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 HAUS6-202ENST00000380502 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 OLFML3-202ENST00000369551 1934 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 LINC01254-202ENST00000567609 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 HERC6-201ENST00000264346 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 CHID1-205ENST00000454838 3255 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 ARMC9-215ENST00000614261 4975 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 RYR1-202ENST00000359596 15117 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC093583.1-201ENST00000462083 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 SMIM22-206ENST00000589327 629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 TMEM184B-201ENST00000361684 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 RAB43-205ENST00000393308 4193 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 DDB2-201ENST00000256996 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 KATNAL1-202ENST00000380617 1634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 PLSCR1-201ENST00000342435 2233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 SNHG14-218ENST00000553108 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 MYL9-201ENST00000279022 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 FAM102A-203ENST00000373095 4144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP25-203ENST00000409220 2939 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 BMP4-205ENST00000558984 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 NFXL1-202ENST00000381538 3728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 DBH-202ENST00000393056 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 RAVER1-201ENST00000293677 3595 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 LAMB3-202ENST00000367030 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 WASF2-202ENST00000618852 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 RP1-207ENST00000637698 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 FAM114A2-211ENST00000520667 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 LILRA2-204ENST00000391738 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AL162591.1-201ENST00000424435 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC8P1-202ENST00000418264 1403 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 LINC01443-202ENST00000584531 1854 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 DPY19L2P3-201ENST00000414296 2326 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 TREH-201ENST00000264029 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 CFAP43-204ENST00000369720 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 PCDHGA8-202ENST00000610569 6480 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 WDR70-201ENST00000265107 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms