Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC34.29■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC34.27■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC34.24■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
MAP3K4Q9Y6R4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
MAP3K4Q9Y6R4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
MAP3K4Q9Y6R4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
MAP3K4Q9Y6R4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
MAP3K4Q9Y6R4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
MAP3K4Q9Y6R4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
MAP3K4Q9Y6R4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
MAP3K4Q9Y6R4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
MAP3K4Q9Y6R4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
MAP3K4Q9Y6R4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
MAP3K4Q9Y6R4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
MAP3K4Q9Y6R4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
MAP3K4Q9Y6R4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
MAP3K4Q9Y6R4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
MAP3K4Q9Y6R4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
MAP3K4Q9Y6R4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
MAP3K4Q9Y6R4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms