Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJA3Q9Y6H8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms