Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARFGEF1Q9Y6D6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
ARFGEF1Q9Y6D6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARFGEF1Q9Y6D6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARFGEF1Q9Y6D6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARFGEF1Q9Y6D6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARFGEF1Q9Y6D6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARFGEF1Q9Y6D6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARFGEF1Q9Y6D6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARFGEF1Q9Y6D6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ARFGEF1Q9Y6D6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ARFGEF1Q9Y6D6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARFGEF1Q9Y6D6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARFGEF1Q9Y6D6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ARFGEF1Q9Y6D6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ARFGEF1Q9Y6D6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARFGEF1Q9Y6D6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARFGEF1Q9Y6D6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARFGEF1Q9Y6D6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARFGEF1Q9Y6D6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARFGEF1Q9Y6D6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARFGEF1Q9Y6D6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARFGEF1Q9Y6D6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARFGEF1Q9Y6D6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARFGEF1Q9Y6D6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARFGEF1Q9Y6D6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms