Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP20Q9Y2K6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms