Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E8

SLC9A8, Sodium/hydrogen exchanger 8, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A8Q9Y2E8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SLC9A8Q9Y2E8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A8Q9Y2E8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A8Q9Y2E8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A8Q9Y2E8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A8Q9Y2E8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A8Q9Y2E8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A8Q9Y2E8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A8Q9Y2E8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A8Q9Y2E8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A8Q9Y2E8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A8Q9Y2E8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A8Q9Y2E8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A8Q9Y2E8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A8Q9Y2E8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A8Q9Y2E8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A8Q9Y2E8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A8Q9Y2E8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A8Q9Y2E8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A8Q9Y2E8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A8Q9Y2E8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A8Q9Y2E8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A8Q9Y2E8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A8Q9Y2E8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A8Q9Y2E8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A8Q9Y2E8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A8Q9Y2E8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A8Q9Y2E8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A8Q9Y2E8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A8Q9Y2E8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A8Q9Y2E8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A8Q9Y2E8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A8Q9Y2E8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A8Q9Y2E8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms