Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHKBQ9Y259 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms