Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms