Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNTN6Q9UQ52 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms