Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC12A4Q9UP95 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms