Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA2Q9UL42 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA2Q9UL42 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms