Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF3C4Q9UKN8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF3C4Q9UKN8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF3C4Q9UKN8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GTF3C4Q9UKN8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms