Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDC42EP3Q9UKI2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms