Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms