Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLCO3A1Q9UIG8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms