Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASIC3Q9UHC3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC3Q9UHC3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms